비교문학연구소는 비교문학협동과정의 전통과 유산을 바탕으로, 독자적인 동시에 탈경계적인 비교문학 연구의 학문적 기반을 구축하기 위해 2023년 인문학연구원 산하 연구소로서 설립되었다. 이를 위한 비교문학연구소의 구체적인 활동 목표는 다음과 같다. 첫째, 다양한 학술행사 기획 및 연구활동 지원을 통해 대학 안팎의 연구자들이 자유롭게 참여하는 활발한 공동연구의 장을 마련한다. 둘째, 비교문학 연구자들의 연구 성과를 알리는 정기 문집을 발간한다. 셋째, 비교문학 수업에 교재로 활용될 수 있는 논저 출간 및 번역 등을 통해 후속 연구자들의 발굴과 양성에 기여한다. 그리하여 전문성과 다양성을 갖춘 비교문학 연구의 산실이 될 수 있도록 노력한다.