본 발명은, 사용자의 호흡 기류 측정과 훈련을 실시할 수 있는 호흡 측정 훈련기와, 상기 호흡 측정 훈련기와 연동되어 사용자의 훈련 결과와 호흡 패턴에 대한 정보를 제공하는 스마트폰을 구비하되, 스마트폰은 호흡 측정 훈련기로부터 호흡량관련 정보에 의해 사용자의 최대호기유량(FEF)과 최대호기유속(PEF)을 검출하여, 이에 따라 호흡훈련의 목표를 맞춤형으로 처방하거나, 자동 설정하며, 다이얼식 저항조절부를 구비하여 보다 정밀히 저항을 조절할 수 있는, 호흡근 강화 훈련 기능을 구비한 휴대용 호흡훈련기 시스템 및 그 제어방법에 관한 것이다. 본 발명은, 일단에 호흡배기 주입부를 구비하고 다른 일단에 호흡 흡기 주입부를 구비하며 사용자의 호흡기류 신호를 측정하는 몸통부를 구비하여 호흡근의 강화훈련을 실시하기 위한 호흡훈련기와, 상기 호흡훈련기와 연동되며 사용자의 호흡 패턴에 대한 정보에 대한 그래프와 수치로 출력하는 스마트폰을 포함하는 휴대용 호흡훈련기 시스템에 있어서, 호흡훈련기의 몸통부는, 호흡 배기 주입부 또는 호흡 흡기 주입부로부터 들어온 공기에 의해 진동하는 진동부를 구비하되, 상기 진동부는 일측에 원추형부를 구비하며, 원추형부의 꼭지점인 원추형부 첨예부는, 진동부가 진동함에 따라, 몸통부에 구비된 진동부 받침 접점부와 접촉하도록 이루어지며, 호흡훈련기의 몸통부는 진동부 받침 접점부와 접촉 여부에 따른 신호에 의해 진동신호를 검출하는 진동검출부를 구비하는 것을 특징으로 한다.