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2000년 이후
2000 과학재단지정 우수연구센터로 단백질네트워크연구센터(PNRC) 선정 (소장 김유삼 교수)
2003 보건복지가족부 질병유전단백체연구지원센터(BPRC) 선정 (소장 백융기 교수)
2006 교육과학기술부 BK21 사업단 선정 (단장 김두식 교수)
2007 연세실험동물연구센터(YLARC) 개소 (센터장 이한웅 교수)
2008 이과대학에서 생명시스템대학 생화학과로 소속 변경
2011 계열별 모집에서 생화학과로 모집 단위 변경
2013 교육부 BK21 플러스 사업단 선정 (단장 권영근 교수)
2019 생화학과 50주년 기념식
2020 교육부 4단계 BK21 교육연구단 선정 (총무 하상준 교수)