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제목
(연구용역)Multilocus sequence analysis(MLSA)를 활용한 검역세균 Xanthomonas spp. 동정시스템 개발
작성자
김건실
작성일
2021.11.24
최종수정일
2021.11.24
조회수
251
분류
교외
부처명
농림축산부
공고기관
농림축산검역본부
링크URL
게시글 내용

1. 과 업 명


Multilocus Sequence Analysis(MLSA)를 활용한 검역세균 Xanthomonas spp. 동정시스템 개발

2. 현황 및 문제점


 Xanthomonas속은 다양한 식물에 경제적, 환경적 피해를 주는 중요한 식물병원세균으로, 현재까지 속 내 31종이 보고되어 있고 그 중 8종이 우리나라의 검역병해충으로 지정되어 있음


❍ 검역병해충으로 지정된 Xanthomonas 중 5종은 10개의 병원형(pathovar)으로 지정되어 있음


❍ 현재 대부분 1개의 유전자에 대한 conventional PCR을 통해 검역세균의 검출 및 동정을 하고 있으나, 이 경우 pathovar 단위에서 동정이 어려울 수 있어 보완이 필요함


3. 과업목표


 1차과업


❍ Xanthomonas spp. 특이적 검사법 개발, 표준균주 확보

- 검역 Xanthomonas 8종은 반드시 포함


 2차과업


❍ MLSA database 및 Tree 기반 동정시스템 개발

- 국경검역에서 검출된 시료를 통한 실증 실험


4. 과업기간


 1차과업 (계약일 ~ '22. 11.15.)


 2차과업 (‘23.1.1. ~ '23. 11.15.)

* 과업기간은 농림축산검역본부와 협의하여 변경 가능


5. 주요 과업 내용


 1차과업


❍ Conventional PCR법으로 Xanthomonas spp.를 검출할 수 있는 특이 primer 개발 및 표준균주 확보

- Xanthomonas속에 포함된 모든 종을 검출하지 않아도 되지만, 검역 Xanthomonas 8종*은 반드시 포함

* X. arboricola, X. axonopodis, X. campestris, X. cucurbitae, X. fragariae, X. oryzae, X. populi, X. vasicola


❍ Xanthomonas속 세균 배양·분리법 개발


❍ MLSA를 위한 유전자군 선정 및 염기서열 MLSA database 구축

- 선정 유전자군 정보 수집 및 primer 개발


 2차과업


❍ MLSA database 구축(계속) 및 Tree 기반 동정시스템 개발

- 미지의 세균으로부터 얻은 염기서열을 입력하여 phylogenetic tree 생성 시스템 구축

* 예) DNA barcode system(www.boldsystems.org)

- 동일 종 또는 병원형으로 동정할 수 있는 염기서열 유사성 threshold 제시


❍ 국경검역에서 검출된 시료를 통한 실증 실험

- 구축된 검사법을 활용하여 수입식물에 적용하고 Xanthomonas속 특이적 PCR 양성반응 시료에 대한 MLSA 동정법 검증실시

6. 기대성과 및 활용 분야


 유전자검사법 미구축 검역세균에 대한 국경검역 강화


❍ 속별 검사를 통해 유전자검사법 미구축 검역세균 검사법 확보


 병원형 등 종 이하 단위로 지정된 검역세균의 동정 정확도 향상


❍ 염기서열 분석 기반 동정 시스템 구축으로 동정 결과에 대한 과학적 정당성을 확보

7. 계약방법 : 일반경쟁입찰(협상에 의한 계약)


 연구용역 사업관리규정 제19조(연구용역비 지급 절차)에 따라 대금 지급


8. 소요예산(총액) : 250,000천원/2년


※ 1차과업 : 120,000천원 / 2차과업 : 130,000천원


9. 입찰참가자격 :


❍ 나라장터에 학술연구용역(업종코드 1169)으로 입찰참가 등록한 업체로서 비영리법인도 참가 가능


10. 공동수급 : 가능


❍ 공동수급(공동이행방식)의 경우 공동수급업체는 입찰 참가자격을 갖추어야 하며, 공동수급체 구성원을 5개 이하로 구성하며, 구성원별 계약 참여 최소지분율은 10% 이상이어야 함


※ 공동수급의 경우 "공동계약 운용요령(기획재정부 계약예규, 입찰공고일 현재용)" 규정을 적용


11. 제출서류


❍ 정성제안서 1부


❍ 발표자료 1부

* 발표: 20분, 질의응답: 20분


❍ 기타서류


12. 기타


❍ 사업담당자 및 연락처 : 위험관리과 임원석, 054-912-0651

첨부
20211121584-00_1637022723170_공고서.hwp 제안요청서 (10).hwp