1. 과 업 명

배나무 mRNA 기반 화상병균 감염주 스크리닝 기술 개발

2. 현황 및 문제점

 ‘15년 국내 발생이 처음으로 확인된 화상병균은 감염지역과 피해가 확대되고 있음❍ 화상병균은 감염 초기에는 가지 등에 국부적으로 감염되어 눈에 띄지 않거나 재배자가 의도‧비의도적으로 감염부위를 제거하여 기상조건 등이 적합할 때 그 피해가 드러나는 역학적 특성이 있음

- 이러한 역학적 특성을 고려할 때, 병원균의 DNA를 추출하여 검사하는 현재의 PCR 검사법으로는 신속한 감염주 예찰이 어려움

❍ 현재 화상병균을 검출하는 표지유전자 마커들은 개발되어 있지만, 과수 나무에 화상병균이 국부적으로 감염된 부위가 채집되지 않는다면 현행의 병원균의 DNA를 추출하여 검사(PCR)하는 방식으로는 검출할 수 없다는 한계가 있음

❍ 화상병균에 감염이 되었으나 병징이 눈에 띄지 않는 경우에도 해당 나무의 어떤 부위를 채취하더라도 감염주 여부를 확인할 수 있는 예찰기술 개발이 필요

3. 과업목표

 (1차년도) 배나무 mRNA 기반 화상병균 감염주 선별 후보 마커 선발

❍ 화상병균 감염주와 건전한 배나무(신고 품종)의 전사체 비교분석을 통해 화상병균에 감염된 배나무를 선별 가능한 mRNA 마커 선발

 (2차년도) mRNA 기반 qRT-PCR 진단 키트 개발

❍ 선발된 후보 마커를 활용하여 AI 학습을 실시하고, 진단 알고리즘을 작성, qRT-PCR 검사 키트 개발

4. 과업기간

 1차년도 (계약일 ~ '22. 11.15.)

 2차년도 (‘23.1.1. ~ '23. 11.15.)

5. 주요 과업 내용

 (1차년도) 후보 마커 선발

❍ 화상병균 감염주와 건전주 배나무(신고 품종)의 전사체 비교분석

- 조직 부위별(잎, 가지 등), 화상병균 처리구별 반복하여 분석

※ RNAseq 10회: 2개 조직(잎, 가지) × 2처리구(감염, 무감염) × 5반복

❍ 화상병균 감염 배나무를 스크린 가능한 mRNA 마커(qRT-PCR) 선발

- (후보마커) 100여개 내외, (최적마커) 5개 이내

❍ 선발된 최적 mRNA 마커의 예비 유효성 검증(검역본부 합동)

- (블라인드 테스트) 감염주와 비감염주 구분 여부

 (2차년도) 진단 체계 구축

❍ AI 학습 프로그램 시험 선정(1개 이상), AI 학습

- 학습 프로그램(10여개 내외)의 유효성 검정 후 선정하여 학습

❍ 화상병균 감염주 스크리닝 알고리즘(엑셀 프로그램 등) 작성

- 학습 프로그램(10여개 내외)의 유효성 검정 후 선정하여 학습

❍ qRT-PCR 검사 키트 제작 및 현장 검증(검역본부 합동)

- 실제 과수원 현장에 적용 가능성 검토

6. 기대성과 및 활용 분야

 과수화상병 예찰·역학조사 및 방제분야 정책 활용

❍ 화상병균에 감염된 배나무의 신속한 예찰, 감역지역 또는 감염주 분포한계 조사에 활용

7. 계약방법 : 일반경쟁입찰(협상에 의한 계약)

 당해 연도의 예산 범위 안에서 단연도 연구과제를 수행하며, 연구용역 사업관리규정 제19조(연구용역비 지급 절차)에 따라 대금 지급

8. 소요예산(총액) : 200,000천원/2년

※ 1차년도 : 100,000천원 / 2차년도 : 100,000천원

9. 입찰참가자격

❍ 나라장터에 학술연구용역(업종코드 1169)으로 입찰참가 등록한 업체로서 비영리법인도 참가 가능

❍ 추정가격 1억원 이상으로서 “국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률” 제4조제1항에 의거 중소기업 참여 가능

10. 공동수급 : 가능

❍ 공동수급(공동이행방식)의 경우 공동수급업체는 입찰 참가자격을 갖추어야 하며, 공동수급체 구성원을 5개 이하로 구성하며, 구성원별 계약 참여 최소지분율은 10% 이상이어야 함

※ 공동수급의 경우 "공동계약 운용요령(기획재정부 계약예규, 입찰공고일 현재용)" 규정을 적용

11. 제출서류

❍ 정성제안서 : 연구용역사업 신청서(기술제안서평가용)

❍ 기타서류 : 입찰참가자격 확인서류

12. 기타

❍ 사업담당자 및 연락처 : 이성진, 054-912-0674