본 발명은 혈관내피세포화를 조절하는 microRNAs 및 그의 용도를 제공한다. 본 발명은 다능성 기질세포의 미분화 상태를 유지하는 miRNA로서, miR-15, -144, -145, -329를 발굴하였으며, 역으로 다능성 기질세포에서 혈관내피세포로의 분화를 유도하는 miRNA로서 miR-26a 및 -29b를 발굴하였다. 이들 miRNA는 다능성 기질세포의 미분화 상태 유지를 위해 miR-15, -144, -145, -329를 활성화할 수 있는 약물, 그리고 혈관내피세포로의 분화 유도를 위한 miR-26a 및 -29b를 활성화할 수 있는 약물의 스크리닝을 위한 마커로서 또는 다능성 기질세포의 미분화 상태 유지 및 다능성 기질세포의 혈관내피세포로의 분화를 유도할 수 있는 유효성분으로서 유용하게 활용될 수 있다.