본 발명은 키토산 용액에 질산은 용액을 첨가하고 교반하여 오토클레이브(autoclave)에 넣은 후 반응시키는 단계를 포함하는 키토산-은 나노 복합물의 제조방법 및 상기 제조방법에 따라 제조된 키토산-은 나노 복합물이 코팅된 항균성 종이에 관한 것으로서, 본 발명의 제조방법에 따라 키토산-은 나노 복합물을 제조하는 경우 Ag 생성 속도를 단축시킬 수 있고, 키토산-은 나노 복합물을 친환경적으로 제조할 수 있으며, 공정설비가 감소되고 제조에 필요한 에너지가 감소되어 매우 경제적인 제조가 가능한 동시에 대량생산이 가능하다는 장점을 나타내며, 본 발명의 제조방법에 따라 제조된 키토산-은 나노 복합물 또는 키토산-은 나노 필름이 코팅된 종이는 우수한 항균성을 나타내는바 식품, 농산물 또는 의료기기, 의약품 포장용 종이로도 유용하게 활용될 수 있다.