본 명세서에서는, 프로세서를 포함하는 NGS 디바이스에 구현되는, NGS 샘플 검증 방법으로서, 미리 결정된 표적 SNP (single-nucleotide polymorphism) 사이트에 대한 서열 정보를 포함하는, 대상 샘플에 대한 복수의 NGS 데이터를 수신하는 단계, 표적 SNP 사이트에 대한 서열 정보를 기초로, 복수의 NGS 데이터 중 동일 개체에서 유래한 샘플 여부를 결정하는 단계, 및 동일 개체 유래 샘플 여부를 제공하는 단계를 포함하는 NGS 샘플 검증 방법 및 이를 이용한 디바이스를 제공한다.