본 발명은, 3차원 구강 스캔 영상 및 3차원 구강 석고 모델 영상을 포함하는 3차원 구강 영상에서 치아 방향을 산출하는 단계와, 3차원 구강 영상에서 치아 방향에 수직한 치아 정렬 평면을 설정하는 단계와, 치아 정렬 평면의 수직 벡터가 3차원 공간 상의 Z축에 평행하도록 3차원 구강 영상을 회전하는 단계와, 회전된 3차원 구강 영상을 X-Y평면에 투사하여 앞니가 정중앙에 보이도록 회전시켜 악궁을 정렬하는 단계를 포함하는 3차원 구강 영상의 자동 정렬 방법을 제공한다.