본 발명에 따른 3D 스캐닝 및 컴퓨터 시뮬레이션을 통한 개인 맞춤형 가이드 기반 치아 치료 시스템은, 환자의 치아의 3차원 스캐닝 데이터를 획득하고 저장하며, 컴퓨터상에서 저장된 치아 데이터를 이용하여 치아 삭제를 위한 계획을 수립하고, 치아 삭제 시뮬레이션, 치아 삭제시 치아에 장착되는 개인 맞춤형 가이드의 디자인 및 삭제된 치아에 장착할 보철물을 디자인하는 치아 데이터 저장 및 시뮬레이션 모듈; 상기 시뮬레이션 모듈에서 디자인된 상기 개인 맞춤형 가이드 및 상기 보철물을 캐드/캠 또는 3D 프린팅 방식으로 제조하는 실물 가공 모듈; 상기 실물 가공 모듈에서 제조된 상기 개인 맞춤형 가이드를 컴퓨터 보조하에 지대치에 설치하며 상기 개인 맞춤형 가이드를 매개로 치아를 삭제하는 치아 삭제 및 가이드 장착 모듈; 외부 네트워크와 유선 또는 무선으로 데이터를 송수할 수 있는 기능을 구비한 원격 진료 모듈; 및 상기 치아 데이터 저장 및 시뮬레이션 모듈, 상기 실물 가공 모듈, 상기 치아 삭제 및 가이드 장착 모듈 및 상기 원격 진료 모듈을 통합적으로 관리하고 각 모듈에서 입력되고 출력되는 데이터를 중계하고 처리하는 역할을 수행하는 제어모듈; 을 포함한 것을 특징으로 한다.