본 발명은 연산기능을 가진 제어서버(10) 및 구조물정보 및 지진정보를 포함하는 정보데이터가 저장된 데이터베이스(20)가 네트워크로 연결되고, 컴퓨터에 의해 실행되는 연속지진 내진성능 평가시스템으로서, 제어서버(10)는 건축물 해석에 사용될 본진을 결정하는 본진 결정부(100); 상기 본진 결정부(100)에서 결정된 본진에 따른 건축물의 보-기둥 접합부의 손상을 파악하는 손상 파악부(200); 본진에 의해 손상된 구조물이 반영된 여진 시나리오를 생성하는 여진 시나리오 생성부(300); 및 생성된 여진 시나리오를 통해 연속지진 내진성능을 평가하는 내진성능 평가부(400)를 포함하는 것을 특징으로 하는 손상된 구조물의 동특성이 반영된 여진시나리오를 통한 연속지진 내진성능 평가시스템이다.