본 발명은 다수의 휘발성 메모리 셀을 포함하는 VM 모듈, 다수의 비휘발성 메모리 셀을 포함하는 NVM 모듈 및 NVM 모듈에 저장된 프로그램을 기지정된 세그먼트 단위로 구분하고, 각 세그먼트에 포함된 라이트 명령의 개수인 세그먼트 카운트를 획득하고 합산하여, 프로그램에 대한 라이트 카운트인 프로그램 카운트를 계산하고, 프로그램 카운트가 기지정된 제1 문턱값 이상인 프로그램의 다수의 세그먼트 중 세그먼트 카운트가 기지정된 제2 문턱값 이상인 세그먼트를 선택하여 VM 모듈에 저장된 데이터와 마이그레이션하고, 마이그레이션된 세그먼트의 데이터 어드레스를 리맵핑하는 메모리 컨트롤 모듈을 포함하여, NVM의 쓰기 횟수를 줄이고 쓰기 속도를 향상시켜, 하이브리드 메모리의 성능을 개선할 수 있는 하이브리드 메모리 장치 및 이의 관리 방법을 제공할 수 있다.