본 발명은 코어; 상기 코어의 표면에 배치되는 복수 개의 자성 입자로 이루어진 쉘; 및 상기 코어의 표면에 결합되어, 세포 표면 표적의 이온 수송 막단백질과 특이적 결합이 가능한 리간드를 포함하는, 세포 활성 조절용 나노입자 및 이를 이용한 세포 활성 조절 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 나노 입자는 표지 단백질이 발현된 특정 이온 수송 막 단백질과 결합할 수 있으며, 개체 외부에 형성된 자기장에 따라 상기 나노입자가 회전함으로써, 이온 수송 막 단백질의 개폐 또는 활성이 조절되어 세포의 활성이 조절된다. 본 발명에 따르면, 비침습적인 방법으로 이온 수송 막 단백질의 개폐, 활성 또는 세포의 활성을 조절할 수 있으므로, 자성유전학적 치료에 유용하게 사용될 수 있다.