본 발명은, 박테리아 표현형 기반 수생태 교란 평가 방법 및 이의 용도에 관한 것으로서, 본 발명은 지하수 시료를 농축하고, 이를 유세포분석으로 분석하여, 세포 크기 및 복잡도에 따른 표현형으로 분류하였다. 또한, 분류된 표현형을 그룹화 하였으며, 지하수 시료에 따른 표현형의 차이를 확인하고, 이를 대조군과 비교하여, 지하수 세균총의 표현형의 차이에 따른 오염 정도나, 오염원을 유추할 수 있는 것을 확인하여, 지하수 생태 교란 평가에 이용할 수 있는 것을 확인하였다.
