본 발명은 연료전지용 냉각시스템에 관한 것으로서, 더욱 상세하게는 동력소모가 없는 자연순환식 2상 열전달 기기를 이용하여 복잡한 연료전지 냉각시스템의 구성을 단순화하는 동시에 전체 시스템의 효율을 향상시킬 수 있도록 한 연료전지용 냉각시스템에 관한 것이다. 이를 위해, 본 발명은 액상의 작동유체가 열을 흡수하여 기상의 작동유체로 증발시켜 배출시키는 증발부; 상기 증발부에서 증발된 기상의 작동유체를 응축시키는 응축부; 상기 증발부에서 기화된 작동유체를 응축부로 이송하는 기체이송관; 및 상기 응축부에서 액화된 작동유체를 증발부로 이송하는 액체이송관을 포함하여 구성되고, 상기 증발부가 연료전지에서 발생한 열을 흡수하여 연료전지를 냉각하는 것을 특징으로 하는 연료전지용 냉각시스템을 제공한다. 연료전지, 열 사이폰, 증발부, 응축부